Paroisse protestante
Merkwiller était jusqu’au début du siècle un village purement protestant. Pour éviter aux paroissiens le trajet jusqu’à Kutzenhausen, la commune décida, malgré l’opposition du Pasteur, d’ériger sa propre église. La première pierre fut posée le 19 juin 1904, l’inauguration ayant lieu le 2 juillet 1905.
Le 5 juin 1908, la foudre détruisit le toit.
Durant l’été 1917 les tuyaux en étain du buffet d’orgue et la grande cloche furent enlevés pour les besoins de la guerre.
En 1927, la soufflerie de l’orgue fut électrifiée.
Christiane Schweickart a fait un don important à la paroisse pour redonner vie et éclat à l’église protestante de Merkwiller. En accord avec la mairie, les travaux de rénovation ont débuté en 2021. l’inauguration de l’église rénovée avec un culte festif, en présence des autorités locales s’est déroulée le 25 septembre 2022.
Paroisse catholique
Le développement de l’industrie pétrolifère du Pechelbronn entraina un afflux de population qui eut pour conséquence une augmentation du nombre d’habitants de confession catholique.
Pour répondre à ces nouvelles attentes,
une nouvelle église fut érigée en 1928.
